Alexander Rombauts defensa la seva tesi doctoral sobre la pneumònia adquirida a la comunitat

La pneumònia adquirida a la comunitat és la principal causa de mortalitat infecciosa mundial, amb una taxa de mortalitat intrahospitalària del 10%. Tot i que Streptococcus pneumoniae en segueix sent l’agent principal, la pneumònia viral està guanyant importància. Les complicacions poden afectar altres òrgans, causant en especial esdeveniments cardíacs aguts que n’empitjoren el pronòstic.

Les noves tecnologies, com ara l’anàlisi metabolòmica, transcriptòmica, genòmica i proteòmica, han permès entendre millor la patogènesi de la pneumònia, tot i que les investigacions sobre el perfil d'expressió gènica són limitades. L'aparició de la SARS-CoV-2 ha incrementat els estudis òmics per examinar la covid-19, oferint oportunitats per estudiar l’heterogeneïtat clínica de la malaltia i la resposta immune.

A la tesi, es van plantejar las següents hipòtesis i objectius:

· El transcriptoma de pacients amb pneumònia adquirida a la comunitat varia entre supervivents i no supervivents.

· Els serotips i complexos clonals d’S. pneumoniae influeixen en els esdeveniments cardíacs aguts. Es van determinar els factors de risc per als esdeveniments cardíacs en la pneumònia pneumocòccica.

· El transcriptoma de pacients amb covid-19 varia entre pacients amb malaltia greu i moderada. Per això, es van comparar els perfils transcriptòmics entre aquests dos grups.

· Les infeccions prèvies per altres coronavirus humans afecten la resposta d'anticossos contra SARS-CoV-2. Es va analitzar la resposta humoral dinàmica contra SARS-CoV-2 i altres coronavirus estacionals.

· La infecció per SARS-CoV-2 genera una immunitat humoral mucosal influïda per exposicions anteriors a altres coronavirus.

· Els pacients amb covid-19 moderada que empitjoren tenen una signatura metabolòmica específica que prediu la progressió de la malaltia. Es va desenvolupar un model predictiu basat en la signatura metabolòmica. Per estudiar les hipòtesis plantejades, es van realitzar en el marc d’aquesta tesi sis estudis en cinc cohorts diferents, incloent l'anàlisi transcriptòmica, els factors de risc d'esdeveniments cardíacs, la resposta humoral i el perfil metabolòmic en pacients amb pneumònia adquirida en la comunitat i covid-19. Els resultats principals van ser:

· Els supervivents de pneumònia mostren gens associats amb l'interferó-alfa, l’apoptosi i les hormones sexuals, mentre que els no supervivents mostren gens associats amb l’estrès oxidatiu i l’angiogènesi.

· Els factors de risc per esdeveniments cardíacs en la pneumònia pneumocòccica inclouen l’edat avançada, les condicions preexistents, la bacterièmia pneumocòccica i els xoc sèptic, sense associació clara amb serotips o complexos clonals.

· La covid-19 greu es caracteritza per una resposta inflamatòria desregulada.

· Hi ha memòria d'anticossos a epítops conservats de betacoronavirus estacionals en infecció per SARS-CoV-2. Aquest ha estat el primer article a demostrar el fenomen de l’imprinting immunològic en SARS-CoV-2.

· Hi ha una resposta robusta d’anticossos a nivell de mucoses contra SARS-CoV-2.

· Aquest treball ha desenvolupat un model predictiu amb un AUC de 0,82 per a la progressió a malaltia greu en covid-19. Per últim, les conclusions principals de la tesi va ser:

· Existeixen diferències en els perfils transcriptòmics entre supervivents i no supervivents de pneumònia, amb potencials biomarcadors de risc.

· Els factors de l'hoste son més importants que els del patogen per desenvolupar esdeveniments cardíacs aguts en pneumònia pneumocòccica.

· Existeix una resposta inflamatòria desregulada en covid-19 greu.

· Existeix l’imprinting immunològic en SARS-CoV-2.

· Hi ha una resposta robusta d'anticossos mucosals en covid-19.

· Aquest treball ha identificat una signatura metabolòmica que prediu la progressió a malaltia greu en covid-19.