Defensa de la tesis de la doctoranda Anna Carrera, del Servicio de Microbiología del HUB e investigadora del IDIBELL

- Investigación

La investigadora Anna Carrera Salinas ha defendido su tesis doctoral, titulada "Epidemiology, population structure, and pathogenesis of opportunistic respiratory tract colonising bacteria", codirigida por Sara Martí y Mª Ángeles Domínguez, investigadoras del CIBERES y del CIBERINF y también del Hospital Universitario de Bellvitge y el Instituto de Investigación Biomédica de Bellvitge (IDIBELL).

La tesis incluye estudios sobre Haemophilus influenzae y Staphylococcus aureus, dos microorganismos colonizadores del tracto respiratorio. Aunque la interacción de estas bacterias con el hospedador normalmente es asintomática, la colonización puede ser el paso previo al desarrollo de infecciones severas. La primera parte de la tesis se centró en la epidemiología de la enfermedad invasiva y la estructura poblacional de H. influenzae. Dado que las cepas no capsuladas eran las más prevalentes y genéticamente heterogéneas, se utilizó una clasificación en clades basada en el genoma accesorio que reveló una asociación del clade V con la producción de β-lactamasas. Esta variabilidad genética contrastaba con la homogeneidad de las cepas capsuladas. Así pues, se estudió la estructura poblacional de todos los genomas capsulados de H. influenza disponibles en el NCBI y ENA. Estos resultados mostraron que el pangenoma del serotipo b era más diverso, lo que podría explicarse por su elevada prevalencia antes de la introducción de la vacuna conjugada. Por otra parte, el serotipo f, actualmente el clon capsulado más frecuente en enfermedad invasiva en nuestro entorno hospitalario, presentó una elevada estabilidad genética.

La segunda parte de la tesis se centró en la evolución adaptativa de H. influenzae y S. aureus. Por un lado, se caracterizaron los cambios genéticos producidos durante la colonización de H. influenzae en pacientes con enfermedad pulmonar obstructiva crónica tratamiento con azitromicina. Se observaron cambios en proteínas implicadas en la pared celular y en el transporte de iones inorgánicos, que favorecerían la adaptación bacteriana. La presión antibiótica condujo al desarrollo de resistencia a macrólidos, debido a alteraciones en el 23S rRNA y en las proteínas ribosomales L4 y L22, y la adquisición de bombas de expulsión MefE y MsrD. En el caso de S. aureus, se caracterizaron los determinantes genéticos implicados en la formación de biofilm y la invasión intracelular. Se identificó que la variante alélica 1 de la proteína de superficie G de S. aureus (SasG) estaba presente en los clones bacteriémicos más frecuentes (CC5 y CC8), correlacionándose con una mayor formación de biofilm. Así pues, esta variante de SasG podría favorecer la colonización y supervivencia bacteriana. Además, se detectaron cambios en genes asociados con la unión a la matriz extracelular (clfB, ebh y fnbA) que podrían causar una pérdida de la capacidad para invadir intracelularmente las células hospedadoras.

Los trabajos de esta tesis doctoral se han realizado gracias a ayudas del Fondo de Investigación en Salud del ISCIII, Sociedad Española de Neumología (SEPAR), CIBER de Enfermedades Respiratorias y el CIBER de Enfermedades Infecciosas, y han sido publicados en revistas de prestigio.

Referències: Tesi: “Epidemiology, population structure, and pathogenesis of opportunistic respiratory tract colonising bacteria”

  • Carrera-Salinas A, González-Díaz A, Ehrlich RL, Berbel D, Tubau F, Pomares X, Garmendia J, Domínguez MÁ, Ardanuy C, Huertas D, Marín A, Montón C, Mell JC, Santos S, Marti S. Genetic Adaptation and Acquisition of Macrolide Resistance in Haemophilus spp. during Persistent Respiratory Tract Colonization in Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Patients Receiving Long-Term Azithromycin Treatment. Microbiol Spectr 2022; Dec 8:e0386022. doi: 10.1128/spectrum.03860-22.
  • Gonzalez-Diaz A, Carrera-Salinas A, Pinto M, Cubero M, van der Ende A, Langereis JD, Domínguez MÁ, Ardanuy C, Bajanca-Lavado P, Marti S. Comparative pangenome analysis of capsulated Haemophilus influenzae serotype f highlights their high genomic stability. Sci Rep 2022; 12(1):3189. doi: 10.1038/s41598-022-07185-5.
  • Carrera-Salinas A, González-Díaz A, Vázquez-Sánchez DA, Camoez M, Niubó J, Càmara J, Ardanuy C, Martí S, Domínguez MÁ; REIPI/GEIH Study Groups. Staphylococcus aureus surface protein G (sasG) allelic variants: correlation between biofilm formation and their prevalence in methicillin-resistant S. aureus (MRSA) clones. Res Microbiol 2022; 173(3):103921. doi: 10.1016/j.resmic.2022.103921.
  • Carrera-Salinas A, González-Díaz A, Calatayud L, Mercado-Maza J, Puig C, Berbel D, Càmara J, Tubau F, Grau I, Domínguez MÁ, Ardanuy C, Martí S. Epidemiology and population structure of Haemophilus influenzae causing invasive disease. Microb Genom 2021; 7(12):000723. doi: 10.1099/mgen.0.000723.

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