El Servicio de Cirugía General y del Aparato Digestivo, está integrado por especialistas dedicados al tratamiento quirúrgico de las enfermedades digestivas, endocrinas y de la pared abdominal. También ofrece asistencia quirúrgica urgente, dentro del Servicio de Urgencias, a los pacientes del área asignada.
Es un centro de referencia en el tratamiento de determinados procedimientos como los distintos tipo de cáncer digestivo, las metástasis hepáticas, la enfermedad inflamatoria intestinal, la obesidad mórbida, la patología compleja del reflujo gastro-esofágico, la patología de las glándulas tiroides, paratiroides y de las suprarrenales, y la cirugía laparoscópica avanzada (obesidad, colon, suprarrenal, litiasis de la vía biliar, melsa y reflujo gastro-esofágico). Hay un programa de trasplante hepático, el pionero en el Estado Español desde 1984.